氨基酸變異(amino acid variant)、致病性預測(pathogenicity prediction)、深度神經網路模型(deep neural network model)、轉移學習(transfer learning)、蛋白質結構(protein structure)、動態(dynamics)、惡性高熱(malignant hyperthermia)、聽損(hearing loss)

分子動力學模擬(Molecular Dynamics Simulations)、原生接觸(Native Contacts)、主成分分析(PCA)、蛋白質穩定性(Protein Stability)、自由能擾動(FEP)、溶質縮放的副本交換(REST2)

老藥新用(Drug repurposing)、胰臟癌(Pancreatic cancer)、自噬(Autophagy)、系綜對接(Ensemble docking)、分子動力學模擬(Molecular dynamics simulations)、自由能擾動(Free energy perturbation)、ATG4B(ATG4B)、LC3B(LC3B)

系綜對接(Ensemble docking)、藥物篩選(Drug screening)、新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)、3C樣蛋白酶(3CL protease)、蛋白質動力學(Protein dynamics)

嚴重特殊傳染性肺炎(SARS-CoV-2)、非結構蛋白16(Nonstructural protein 16 (Nsp16))、分子動力學模擬(Molecular dynamics simulations)、可藥動態組(Druggable DynOmics)、加帽RNA合成(Capped RNA synthesis)、老藥新用(Drug repurposing)

噪音敏感度(noise sensitivity)、噪聲響應(Noise response)、攝動(Perturbation)、系統生物學(Systems biology)、化學反應網絡(Chemical reaction network)

新型冠狀病毒(COVID-19)、化學相似性搜索引擎(SARS-CoV2)

溫度敏感型(temperature sensitive)、胺基酸水膠(polypeptide hydrogel)、三鈣磷酸鹽(tricalcium phosphate)、高濃度血小板(PRP)、骨組織工程(bone tissue engineering)

老藥新用(drug repurposing)、藥物篩選(drug screening)、分子對接(molecular docking)、分子動力學模擬(molecular dynamics (MD) simulations)、MM/GBSA(MM/GBSA)、ANM(ANM)、LRT(LRT)、FDA核准藥物(FDA-approved drugs)、ATG4B(ATG4B)、tioconazole(tioconazole)、異位調控(allosteric regulation)、DRDOCK(DRDOCK)、SARS-CoV2(SARS-CoV2)、COVID-19(COVID-19)、偽結(pseudoknot)、-1轉錄框降轉移 (-1 PRF)(-1 programmed ribosomal frameshifting (-1 PRF))

蛋白質動力學模擬(Molecular Dynamics Simulations)、各向性異構網路模型(Anisotropic Elastic Network Model)、主成分分析(principal Component Analysis)

老藥新用(Drug repurposing)、自噬作用(Autophagy)、系綜對接(Ensemble docking)、異構調控(Allosteric regulation)、藥物篩選(Drug screening)

抗菌胜肽(Antimicrobial Peptides)、疏水矩(Simulations)、模擬(Hydrophobic Moment)

分子對接(Protein-drug docking)、分子動力學模擬(MD simulation)、自噬作用(Autophagy)、蛋白間交界面(Protein-protein interface)、模糊相互作用束縛(Ambiguous interaction restraints)、藥物篩選(Drug screening)

鴉片類藥物(opioid drug)、促進劑(agonist)、抑制劑(antagonist)、鴉片類受體(opioid receptor)、分子對接(molecular docking)、分子動力學模擬(molecular dynamics simulation)

泛病毒(Pan-virus)、病毒蛋白酶(Pharmacophore anchors)、藥理錨(Drug repurposing)、藥物利用(Dengue Virus)、登革熱病毒(Zika Virus)、寨卡病毒(COVID-19)、2019冠狀病毒(undefined)

蛋白質關聯網路(Protein association network)、N-端醣基化位點(N-linked glycosites)、DNA結合蛋白(DNA binding protein)

彈力網路模型(ENM)、高斯網路模型(GNM)、非勻向網路模型(ANM)、環境非勻向網路模型(envANM)、動態組(DynOmics)、固有動態域(Intrinsic dynamics domains)、固有動態(Intrinsic dynamics)、蛋白動態(Protein dynamics)、深度神經網路模型(Deep neural network)、構型集合(Native ensemble)、對接(Docking)、分子動力模擬(MD)、溫度因子(B-factor)、絕對振盪大小(Absolute fluctuations size)、頻譜熵(Spectral entropy)、剽竊(Plagiarism)、BWT轉換(BWT Burrows-Wheeler transform)、FM索引(FM index)、隱私保護(privacy protection)

-1計畫性核醣體轉譯軌道移轉(-1 Programmed Ribosomal Frameshifting)、茲卡病毒(PRF-Hunter)、滑動序列(Zika virus)、髮夾結構(Slippery sequence)、偽結(Hairpin)、體外轉譯軌道移轉檢測法(Pseudoknot)、黃病毒屬(in vitro frameshifting assay)

核酸(nucleic acid)、核糖體(protein)、DNA 折彎(ribosome)、RNA(DNA kinking protein)、偽結(RNA)、轉譯框架位移(Sac7d)、彈力網路模型(RNA recognition motif)、線性響應理論(RRM1)、分子動力模擬(RRM2)、引導模擬(TDP-43)、自適應模擬(pseudoknot)、目標誘導模擬(frameshifting)、螺旋胜肽資料庫(elastic network model)、搜尋引擎(linear response theory)、抗癌胜肽(molecular dynamics simulations)、抗菌胜肽(steered MD simulations)、剽竊比對(adaptively biased MD simulations)、動態規劃演算法(targeted MD simulations)、資料庫索引(helical peptide database)、隱私(search engine)、SAVE(anti-tumor peptide)、MD(Sgo1)

蛋白質-核酸交互作用(protein-DNA/RNA interaction)、RNA伴護蛋白(TDP-43)、解旋(RNA chaperone)、G-四聯體(unwinding)、螢光非等向性(G-quadruplex)、分子動態電腦模擬(Fluorescence Anisotropy)、螢光電泳移動位切實驗(MD simulations)

蛋白質振盪(protein fluctuation)、彈力網路模型(elastic network model (ENM))、機器學習(machine learning)、深度學習(deep neural networks (DNN))、分子動力模擬(molecular dynamics simulation (MD))、熵(Shannon entropy)、構型的集合(native ensemble)、蛋白質形狀(protein shape)、核磁共振(nuclear magnetic resonance)、X射線晶體學(x-ray crystallography)、特徵值(eigenvalue)、隨機森林(random forest)、線性回歸(linear regression)

TAR去氧核糖核酸結合酶-43(TDP-43)、RNA結合蛋白(RNA-binding protein)、RNA識別基序(RNA recognition motif)、DNA解旋酶(DNA helicase)、單股DNA結合(ssDNA binding)、分子動力學模擬(molecular dynamics simulation)、演化(evolution)、雙股DNA結合位(dsDNA binding site)、高斯加速分子動力學(Gaussian accelerated MD)、富含TG基序(TG-rich motif)、富含UG基序(UG-rich motif)、力場(AMBER)、分子力學泊松-玻爾茲曼表面積(MM/PBSA)、伴隨蛋白(chaperone)、傅立葉轉換分子對接(FTDOCK)、固有動態結構域(intrinsic dynamics domain)

植物(PHT1;1)、磷酸(PiPT)、轉運膜蛋白(phosphate)、機械化學(transport)、無機磷(membrane)

鹽橋(FGF2)、多聚體結構(Phosphorylation)、磷酸化(Intermolecular Salt Bridge)、分子動力模擬(Molecular Dynamics Simulations)

蛋白質構型變化(protein conformational changes)、線性響應理論(Linear Response Theory)、分子動力模擬(Molecular Dynamics Simulations)、彈性網絡模型(ENM)

酵素(enzyme)、活性位點預測(active site prediction)、序列(conservation)、結構(intrinsic dynamics)、固有動態(solvent accessibility)、保留性分數(acid dissociation constant)、相對溶劑可接觸表面積(spatial clustering score)、酸解離常數(Gaussian Network Model)、空間叢集化分數(GNM)、多元回歸(partial least squares regression)、催化位點(PLS)

彈性網絡模型(ENM)、構型變化(Conformational change)、DNA結合蛋白質(protein-DNA binding)、DNA結合蛋白質結合位點(protein-DNA binding site)、預測酵素活性位置(Enzyme active site prediction)