致病性預測(Pathogenicity prediction)、機器學習(machine learning)、人工智慧(AI)、蛋白質動力學(protein dynamics)、深度神經網路(deep neural network)

氨基酸變異(amino acid variant)、致病性預測(pathogenicity prediction)、深度神經網路模型(deep neural network model)、轉移學習(transfer learning)、蛋白質結構(protein structure)、動態(dynamics)、惡性高熱(malignant hyperthermia)、聽損(hearing loss)

分子動力學模擬(Molecular Dynamics Simulations)、原生接觸(Native Contacts)、主成分分析(PCA)、蛋白質穩定性(Protein Stability)、自由能擾動(FEP)、溶質縮放的副本交換(REST2)

老藥新用(Drug repurposing)、胰臟癌(Pancreatic cancer)、自噬(Autophagy)、系綜對接(Ensemble docking)、分子動力學模擬(Molecular dynamics simulations)、自由能擾動(Free energy perturbation)、ATG4B(ATG4B)、LC3B(LC3B)

系綜對接(Ensemble docking)、藥物篩選(Drug screening)、新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)、3C樣蛋白酶(3CL protease)、蛋白質動力學(Protein dynamics)

嚴重特殊傳染性肺炎(SARS-CoV-2)、非結構蛋白16(Nonstructural protein 16 (Nsp16))、分子動力學模擬(Molecular dynamics simulations)、可藥動態組(Druggable DynOmics)、加帽RNA合成(Capped RNA synthesis)、老藥新用(Drug repurposing)

噪音敏感度(noise sensitivity)、噪聲響應(Noise response)、攝動(Perturbation)、系統生物學(Systems biology)、化學反應網絡(Chemical reaction network)

新型冠狀病毒(COVID-19)、化學相似性搜索引擎(SARS-CoV2)

溫度敏感型(temperature sensitive)、胺基酸水膠(polypeptide hydrogel)、三鈣磷酸鹽(tricalcium phosphate)、高濃度血小板(PRP)、骨組織工程(bone tissue engineering)

老藥新用(drug repurposing)、藥物篩選(drug screening)、分子對接(molecular docking)、分子動力學模擬(molecular dynamics (MD) simulations)、MM/GBSA(MM/GBSA)、ANM(ANM)、LRT(LRT)、FDA核准藥物(FDA-approved drugs)、ATG4B(ATG4B)、tioconazole(tioconazole)、異位調控(allosteric regulation)、DRDOCK(DRDOCK)、SARS-CoV2(SARS-CoV2)、COVID-19(COVID-19)、偽結(pseudoknot)、-1轉錄框降轉移 (-1 PRF)(-1 programmed ribosomal frameshifting (-1 PRF))

蛋白質動力學模擬(Molecular Dynamics Simulations)、各向性異構網路模型(Anisotropic Elastic Network Model)、主成分分析(principal Component Analysis)

老藥新用(Drug repurposing)、自噬作用(Autophagy)、系綜對接(Ensemble docking)、異構調控(Allosteric regulation)、藥物篩選(Drug screening)

抗菌胜肽(Antimicrobial Peptides)、疏水矩(Simulations)、模擬(Hydrophobic Moment)

分子對接(Protein-drug docking)、分子動力學模擬(MD simulation)、自噬作用(Autophagy)、蛋白間交界面(Protein-protein interface)、模糊相互作用束縛(Ambiguous interaction restraints)、藥物篩選(Drug screening)

鴉片類藥物(opioid drug)、促進劑(agonist)、抑制劑(antagonist)、鴉片類受體(opioid receptor)、分子對接(molecular docking)、分子動力學模擬(molecular dynamics simulation)

泛病毒(Pan-virus)、病毒蛋白酶(Pharmacophore anchors)、藥理錨(Drug repurposing)、藥物利用(Dengue Virus)、登革熱病毒(Zika Virus)、寨卡病毒(COVID-19)、2019冠狀病毒(undefined)

蛋白質關聯網路(Protein association network)、N-端醣基化位點(N-linked glycosites)、DNA結合蛋白(DNA binding protein)

彈力網路模型(ENM)、高斯網路模型(GNM)、非勻向網路模型(ANM)、環境非勻向網路模型(envANM)、動態組(DynOmics)、固有動態域(Intrinsic dynamics domains)、固有動態(Intrinsic dynamics)、蛋白動態(Protein dynamics)、深度神經網路模型(Deep neural network)、構型集合(Native ensemble)、對接(Docking)、分子動力模擬(MD)、溫度因子(B-factor)、絕對振盪大小(Absolute fluctuations size)、頻譜熵(Spectral entropy)、剽竊(Plagiarism)、BWT轉換(BWT Burrows-Wheeler transform)、FM索引(FM index)、隱私保護(privacy protection)

-1計畫性核醣體轉譯軌道移轉(-1 Programmed Ribosomal Frameshifting)、茲卡病毒(PRF-Hunter)、滑動序列(Zika virus)、髮夾結構(Slippery sequence)、偽結(Hairpin)、體外轉譯軌道移轉檢測法(Pseudoknot)、黃病毒屬(in vitro frameshifting assay)

核酸(nucleic acid)、核糖體(protein)、DNA 折彎(ribosome)、RNA(DNA kinking protein)、偽結(RNA)、轉譯框架位移(Sac7d)、彈力網路模型(RNA recognition motif)、線性響應理論(RRM1)、分子動力模擬(RRM2)、引導模擬(TDP-43)、自適應模擬(pseudoknot)、目標誘導模擬(frameshifting)、螺旋胜肽資料庫(elastic network model)、搜尋引擎(linear response theory)、抗癌胜肽(molecular dynamics simulations)、抗菌胜肽(steered MD simulations)、剽竊比對(adaptively biased MD simulations)、動態規劃演算法(targeted MD simulations)、資料庫索引(helical peptide database)、隱私(search engine)、SAVE(anti-tumor peptide)、MD(Sgo1)

蛋白質-核酸交互作用(protein-DNA/RNA interaction)、RNA伴護蛋白(TDP-43)、解旋(RNA chaperone)、G-四聯體(unwinding)、螢光非等向性(G-quadruplex)、分子動態電腦模擬(Fluorescence Anisotropy)、螢光電泳移動位切實驗(MD simulations)

蛋白質振盪(protein fluctuation)、彈力網路模型(elastic network model (ENM))、機器學習(machine learning)、深度學習(deep neural networks (DNN))、分子動力模擬(molecular dynamics simulation (MD))、熵(Shannon entropy)、構型的集合(native ensemble)、蛋白質形狀(protein shape)、核磁共振(nuclear magnetic resonance)、X射線晶體學(x-ray crystallography)、特徵值(eigenvalue)、隨機森林(random forest)、線性回歸(linear regression)

TAR去氧核糖核酸結合酶-43(TDP-43)、RNA結合蛋白(RNA-binding protein)、RNA識別基序(RNA recognition motif)、DNA解旋酶(DNA helicase)、單股DNA結合(ssDNA binding)、分子動力學模擬(molecular dynamics simulation)、演化(evolution)、雙股DNA結合位(dsDNA binding site)、高斯加速分子動力學(Gaussian accelerated MD)、富含TG基序(TG-rich motif)、富含UG基序(UG-rich motif)、力場(AMBER)、分子力學泊松-玻爾茲曼表面積(MM/PBSA)、伴隨蛋白(chaperone)、傅立葉轉換分子對接(FTDOCK)、固有動態結構域(intrinsic dynamics domain)

植物(PHT1;1)、磷酸(PiPT)、轉運膜蛋白(phosphate)、機械化學(transport)、無機磷(membrane)

鹽橋(FGF2)、多聚體結構(Phosphorylation)、磷酸化(Intermolecular Salt Bridge)、分子動力模擬(Molecular Dynamics Simulations)

蛋白質構型變化(protein conformational changes)、線性響應理論(Linear Response Theory)、分子動力模擬(Molecular Dynamics Simulations)、彈性網絡模型(ENM)

酵素(enzyme)、活性位點預測(active site prediction)、序列(conservation)、結構(intrinsic dynamics)、固有動態(solvent accessibility)、保留性分數(acid dissociation constant)、相對溶劑可接觸表面積(spatial clustering score)、酸解離常數(Gaussian Network Model)、空間叢集化分數(GNM)、多元回歸(partial least squares regression)、催化位點(PLS)

彈性網絡模型(ENM)、構型變化(Conformational change)、DNA結合蛋白質(protein-DNA binding)、DNA結合蛋白質結合位點(protein-DNA binding site)、預測酵素活性位置(Enzyme active site prediction)